Ο Απόστολος Μιχαηλίδης γεννήθηκε το 1965. Το 1987 αποφοίτησε από το Τμήμα Θεολογίας του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης. Συνέχισε τις μεταπτυχιακές του σπουδές (1990-1993) στο Department of Philosophy and Religion του Banaras Hindu University (Βαρανάσι, Ινδία), απ’ όπου έλαβε Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Ειδίκευσης (Master of Arts in Indian Philosophy and Religion). Το 2005 αναγορεύθηκε ομοθύμως αριστούχος διδάκτορας του Τμήματος Θεολογίας του Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών. Από το 1995 έως το 2020 υπηρέτησε στη Μέση εκπαίδευση. Υπηρέτησε, επίσης, κατά περιόδους ως διδάσκων σε πανεπιστημιακά Τμήματα, είτε σε προπτυχιακό είτε σε μεταπτυχιακό επίπεδο. Από την 6η Οκτωβρίου του 2020 ανέλαβε υπηρεσία ως μέλος Ε.ΔΙ.Π. του Τμήματος Κοινωνικής Θεολογίας και Θρησκειολογίας του Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών με γνωστικό αντικείμενο «Ινδουισμός και Ανατολικά Θρησκεύματα». Την 20η Μαρτίου 2023 εξελέγη στη θέση του Επίκουρου Καθηγητή για το γνωστικό αντικείμενο «Ινδουισμός».